Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GKAP1Q5VSY0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GKAP1Q5VSY0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms