Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1orf220Q5T0J3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1orf220Q5T0J3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf220Q5T0J3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms