Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C10orf55Q5SWW7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms