Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTC39AQ5SRH9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTC39AQ5SRH9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms