Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQH8

C6orf136, Uncharacterized protein C6orf136, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf136Q5SQH8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C6orf136Q5SQH8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C6orf136Q5SQH8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms