Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FAM47AQ5JRC9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FAM47AQ5JRC9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FAM47AQ5JRC9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FAM47AQ5JRC9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM47AQ5JRC9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM47AQ5JRC9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM47AQ5JRC9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM47AQ5JRC9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM47AQ5JRC9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM47AQ5JRC9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM47AQ5JRC9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM47AQ5JRC9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM47AQ5JRC9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM47AQ5JRC9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM47AQ5JRC9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM47AQ5JRC9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM47AQ5JRC9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM47AQ5JRC9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM47AQ5JRC9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM47AQ5JRC9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM47AQ5JRC9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM47AQ5JRC9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM47AQ5JRC9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM47AQ5JRC9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM47AQ5JRC9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM47AQ5JRC9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM47AQ5JRC9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM47AQ5JRC9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM47AQ5JRC9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM47AQ5JRC9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM47AQ5JRC9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM47AQ5JRC9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM47AQ5JRC9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM47AQ5JRC9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM47AQ5JRC9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM47AQ5JRC9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM47AQ5JRC9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms