Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CT47A1Q5JQC4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CT47A1Q5JQC4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms