Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
MS4A13Q5J8X5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A13Q5J8X5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms