Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH70

XKR9, XK-related protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR9Q5GH70 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XKR9Q5GH70 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XKR9Q5GH70 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XKR9Q5GH70 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
XKR9Q5GH70 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
XKR9Q5GH70 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
XKR9Q5GH70 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
XKR9Q5GH70 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms