Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF628Q5EBL2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF628Q5EBL2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF628Q5EBL2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF628Q5EBL2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF628Q5EBL2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF628Q5EBL2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF628Q5EBL2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF628Q5EBL2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF628Q5EBL2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF628Q5EBL2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF628Q5EBL2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF628Q5EBL2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF628Q5EBL2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF628Q5EBL2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF628Q5EBL2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF628Q5EBL2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF628Q5EBL2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF628Q5EBL2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF628Q5EBL2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF628Q5EBL2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ZNF628Q5EBL2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms