Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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C9orf116Q5BN46 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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C9orf116Q5BN46 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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C9orf116Q5BN46 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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C9orf116Q5BN46 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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C9orf116Q5BN46 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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C9orf116Q5BN46 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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C9orf116Q5BN46 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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C9orf116Q5BN46 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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C9orf116Q5BN46 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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C9orf116Q5BN46 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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C9orf116Q5BN46 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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