Protein–RNA interactions for Protein: Q53F19

NCBP3, Nuclear cap-binding protein subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP3Q53F19 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NCBP3Q53F19 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NCBP3Q53F19 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NCBP3Q53F19 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NCBP3Q53F19 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NCBP3Q53F19 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NCBP3Q53F19 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NCBP3Q53F19 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NCBP3Q53F19 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NCBP3Q53F19 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NCBP3Q53F19 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NCBP3Q53F19 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCBP3Q53F19 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCBP3Q53F19 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCBP3Q53F19 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCBP3Q53F19 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCBP3Q53F19 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCBP3Q53F19 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCBP3Q53F19 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCBP3Q53F19 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NCBP3Q53F19 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NCBP3Q53F19 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NCBP3Q53F19 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NCBP3Q53F19 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NCBP3Q53F19 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NCBP3Q53F19 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NCBP3Q53F19 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NCBP3Q53F19 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NCBP3Q53F19 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NCBP3Q53F19 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NCBP3Q53F19 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NCBP3Q53F19 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NCBP3Q53F19 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms