Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms