Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM259Q4ZIN3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms