Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYTL3Q4VX76 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms