Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUSP28Q4G0W2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
DUSP28Q4G0W2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP28Q4G0W2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms