Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SP6Q3SY56 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.2 ms