Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms