Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIW9

DPCR1, Diffuse panbronchiolitis critical region protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPCR1Q3MIW9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DPCR1Q3MIW9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DPCR1Q3MIW9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DPCR1Q3MIW9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DPCR1Q3MIW9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DPCR1Q3MIW9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DPCR1Q3MIW9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DPCR1Q3MIW9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DPCR1Q3MIW9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DPCR1Q3MIW9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DPCR1Q3MIW9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DPCR1Q3MIW9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DPCR1Q3MIW9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DPCR1Q3MIW9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DPCR1Q3MIW9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DPCR1Q3MIW9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DPCR1Q3MIW9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DPCR1Q3MIW9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DPCR1Q3MIW9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DPCR1Q3MIW9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DPCR1Q3MIW9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DPCR1Q3MIW9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DPCR1Q3MIW9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DPCR1Q3MIW9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DPCR1Q3MIW9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DPCR1Q3MIW9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DPCR1Q3MIW9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DPCR1Q3MIW9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DPCR1Q3MIW9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DPCR1Q3MIW9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DPCR1Q3MIW9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DPCR1Q3MIW9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DPCR1Q3MIW9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DPCR1Q3MIW9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DPCR1Q3MIW9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DPCR1Q3MIW9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DPCR1Q3MIW9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DPCR1Q3MIW9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DPCR1Q3MIW9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DPCR1Q3MIW9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DPCR1Q3MIW9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DPCR1Q3MIW9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DPCR1Q3MIW9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DPCR1Q3MIW9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DPCR1Q3MIW9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DPCR1Q3MIW9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DPCR1Q3MIW9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DPCR1Q3MIW9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DPCR1Q3MIW9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DPCR1Q3MIW9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DPCR1Q3MIW9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DPCR1Q3MIW9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DPCR1Q3MIW9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148 ms