Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NBPF8Q3BBV2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NBPF8Q3BBV2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NBPF8Q3BBV2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NBPF8Q3BBV2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NBPF8Q3BBV2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NBPF8Q3BBV2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NBPF8Q3BBV2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NBPF8Q3BBV2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NBPF8Q3BBV2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NBPF8Q3BBV2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NBPF8Q3BBV2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
NBPF8Q3BBV2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NBPF8Q3BBV2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NBPF8Q3BBV2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NBPF8Q3BBV2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NBPF8Q3BBV2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NBPF8Q3BBV2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NBPF8Q3BBV2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NBPF8Q3BBV2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NBPF8Q3BBV2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NBPF8Q3BBV2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NBPF8Q3BBV2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NBPF8Q3BBV2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NBPF8Q3BBV2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NBPF8Q3BBV2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NBPF8Q3BBV2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NBPF8Q3BBV2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NBPF8Q3BBV2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NBPF8Q3BBV2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NBPF8Q3BBV2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NBPF8Q3BBV2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NBPF8Q3BBV2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NBPF8Q3BBV2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NBPF8Q3BBV2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NBPF8Q3BBV2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NBPF8Q3BBV2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NBPF8Q3BBV2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NBPF8Q3BBV2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NBPF8Q3BBV2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NBPF8Q3BBV2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NBPF8Q3BBV2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NBPF8Q3BBV2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NBPF8Q3BBV2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NBPF8Q3BBV2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NBPF8Q3BBV2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
NBPF8Q3BBV2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NBPF8Q3BBV2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NBPF8Q3BBV2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NBPF8Q3BBV2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
NBPF8Q3BBV2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
NBPF8Q3BBV2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NBPF8Q3BBV2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NBPF8Q3BBV2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NBPF8Q3BBV2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NBPF8Q3BBV2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms