Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC96Q2M329 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC96Q2M329 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms