Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC27Q2M243 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC27Q2M243 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC27Q2M243 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC27Q2M243 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC27Q2M243 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC27Q2M243 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC27Q2M243 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC27Q2M243 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC27Q2M243 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC27Q2M243 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC27Q2M243 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC27Q2M243 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC27Q2M243 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC27Q2M243 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC27Q2M243 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC27Q2M243 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC27Q2M243 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC27Q2M243 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC27Q2M243 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC27Q2M243 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC27Q2M243 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC27Q2M243 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC27Q2M243 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC27Q2M243 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC27Q2M243 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC27Q2M243 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC27Q2M243 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC27Q2M243 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC27Q2M243 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC27Q2M243 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC27Q2M243 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC27Q2M243 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC27Q2M243 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC27Q2M243 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC27Q2M243 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms