Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SWI5Q1ZZU3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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