Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIL3Q16649 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
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NFIL3Q16649 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
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NFIL3Q16649 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
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NFIL3Q16649 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NFIL3Q16649 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIL3Q16649 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
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