Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF239Q16600 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF239Q16600 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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