Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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SGCAQ16586 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
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SGCAQ16586 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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SGCAQ16586 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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SGCAQ16586 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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SGCAQ16586 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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SGCAQ16586 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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SGCAQ16586 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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SGCAQ16586 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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SGCAQ16586 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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SGCAQ16586 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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SGCAQ16586 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCAQ16586 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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