Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPE65Q16518 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPE65Q16518 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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