Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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TNXAQ16473 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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TNXAQ16473 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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TNXAQ16473 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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TNXAQ16473 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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TNXAQ16473 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TNXAQ16473 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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