Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCD2Q16342 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDCD2Q16342 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCD2Q16342 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
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