Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZIC1Q15915 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZIC1Q15915 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZIC1Q15915 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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