Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZFHX3Q15911 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZFHX3Q15911 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZFHX3Q15911 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZFHX3Q15911 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZFHX3Q15911 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZFHX3Q15911 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZFHX3Q15911 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZFHX3Q15911 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZFHX3Q15911 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZFHX3Q15911 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZFHX3Q15911 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZFHX3Q15911 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZFHX3Q15911 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZFHX3Q15911 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZFHX3Q15911 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZFHX3Q15911 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZFHX3Q15911 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZFHX3Q15911 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZFHX3Q15911 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZFHX3Q15911 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZFHX3Q15911 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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ZFHX3Q15911 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZFHX3Q15911 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZFHX3Q15911 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZFHX3Q15911 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZFHX3Q15911 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZFHX3Q15911 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZFHX3Q15911 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ZFHX3Q15911 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZFHX3Q15911 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZFHX3Q15911 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZFHX3Q15911 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ZFHX3Q15911 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZFHX3Q15911 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ZFHX3Q15911 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ZFHX3Q15911 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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