Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIP4Q15650 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIP4Q15650 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIP4Q15650 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIP4Q15650 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIP4Q15650 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIP4Q15650 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIP4Q15650 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIP4Q15650 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIP4Q15650 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIP4Q15650 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIP4Q15650 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIP4Q15650 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIP4Q15650 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIP4Q15650 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIP4Q15650 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIP4Q15650 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIP4Q15650 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIP4Q15650 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIP4Q15650 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIP4Q15650 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIP4Q15650 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIP4Q15650 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIP4Q15650 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIP4Q15650 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIP4Q15650 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIP4Q15650 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIP4Q15650 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIP4Q15650 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIP4Q15650 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIP4Q15650 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIP4Q15650 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIP4Q15650 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIP4Q15650 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIP4Q15650 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIP4Q15650 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIP4Q15650 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIP4Q15650 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIP4Q15650 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIP4Q15650 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIP4Q15650 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
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