Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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SEC23BQ15437 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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SEC23BQ15437 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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SEC23BQ15437 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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SEC23BQ15437 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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SEC23BQ15437 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
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SEC23BQ15437 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEC23BQ15437 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEC23BQ15437 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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SEC23BQ15437 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEC23BQ15437 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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SEC23BQ15437 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEC23BQ15437 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEC23BQ15437 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEC23BQ15437 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEC23BQ15437 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEC23BQ15437 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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