Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SF3B3Q15393 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SF3B3Q15393 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SF3B3Q15393 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SF3B3Q15393 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SF3B3Q15393 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SF3B3Q15393 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SF3B3Q15393 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SF3B3Q15393 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SF3B3Q15393 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SF3B3Q15393 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SF3B3Q15393 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SF3B3Q15393 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SF3B3Q15393 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SF3B3Q15393 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SF3B3Q15393 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SF3B3Q15393 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SF3B3Q15393 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SF3B3Q15393 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SF3B3Q15393 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SF3B3Q15393 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SF3B3Q15393 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SF3B3Q15393 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SF3B3Q15393 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SF3B3Q15393 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SF3B3Q15393 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SF3B3Q15393 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SF3B3Q15393 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SF3B3Q15393 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SF3B3Q15393 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SF3B3Q15393 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SF3B3Q15393 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SF3B3Q15393 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SF3B3Q15393 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SF3B3Q15393 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SF3B3Q15393 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SF3B3Q15393 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SF3B3Q15393 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SF3B3Q15393 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SF3B3Q15393 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SF3B3Q15393 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SF3B3Q15393 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SF3B3Q15393 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SF3B3Q15393 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SF3B3Q15393 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SF3B3Q15393 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SF3B3Q15393 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
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