Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
UBE3CQ15386 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
UBE3CQ15386 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms