Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NKX1-1Q15270 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NKX1-1Q15270 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms