Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD3Q15054 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLD3Q15054 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
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