Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
R3HDM1Q15032 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
R3HDM1Q15032 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
R3HDM1Q15032 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
R3HDM1Q15032 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
R3HDM1Q15032 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
R3HDM1Q15032 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
R3HDM1Q15032 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
R3HDM1Q15032 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
R3HDM1Q15032 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
R3HDM1Q15032 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
R3HDM1Q15032 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
R3HDM1Q15032 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
R3HDM1Q15032 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
R3HDM1Q15032 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
R3HDM1Q15032 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
R3HDM1Q15032 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
R3HDM1Q15032 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
R3HDM1Q15032 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
R3HDM1Q15032 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
R3HDM1Q15032 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
R3HDM1Q15032 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
R3HDM1Q15032 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
R3HDM1Q15032 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
R3HDM1Q15032 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
R3HDM1Q15032 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
R3HDM1Q15032 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
R3HDM1Q15032 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
R3HDM1Q15032 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
R3HDM1Q15032 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
R3HDM1Q15032 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
R3HDM1Q15032 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
R3HDM1Q15032 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
R3HDM1Q15032 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
R3HDM1Q15032 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
R3HDM1Q15032 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
R3HDM1Q15032 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
R3HDM1Q15032 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
R3HDM1Q15032 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
R3HDM1Q15032 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
R3HDM1Q15032 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
R3HDM1Q15032 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
R3HDM1Q15032 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
R3HDM1Q15032 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
R3HDM1Q15032 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
R3HDM1Q15032 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
R3HDM1Q15032 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
R3HDM1Q15032 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
R3HDM1Q15032 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
R3HDM1Q15032 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
R3HDM1Q15032 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
R3HDM1Q15032 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
R3HDM1Q15032 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
R3HDM1Q15032 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
R3HDM1Q15032 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
R3HDM1Q15032 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
R3HDM1Q15032 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
R3HDM1Q15032 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
R3HDM1Q15032 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
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