Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NCAPD2Q15021 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NCAPD2Q15021 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NCAPD2Q15021 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NCAPD2Q15021 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
NCAPD2Q15021 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
NCAPD2Q15021 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NCAPD2Q15021 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NCAPD2Q15021 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NCAPD2Q15021 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NCAPD2Q15021 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NCAPD2Q15021 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NCAPD2Q15021 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NCAPD2Q15021 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NCAPD2Q15021 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NCAPD2Q15021 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NCAPD2Q15021 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NCAPD2Q15021 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
NCAPD2Q15021 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
NCAPD2Q15021 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NCAPD2Q15021 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.41
NCAPD2Q15021 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NCAPD2Q15021 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NCAPD2Q15021 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NCAPD2Q15021 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NCAPD2Q15021 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NCAPD2Q15021 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NCAPD2Q15021 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
NCAPD2Q15021 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NCAPD2Q15021 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NCAPD2Q15021 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NCAPD2Q15021 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NCAPD2Q15021 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NCAPD2Q15021 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NCAPD2Q15021 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
NCAPD2Q15021 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NCAPD2Q15021 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NCAPD2Q15021 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NCAPD2Q15021 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NCAPD2Q15021 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NCAPD2Q15021 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NCAPD2Q15021 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NCAPD2Q15021 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NCAPD2Q15021 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NCAPD2Q15021 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NCAPD2Q15021 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NCAPD2Q15021 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NCAPD2Q15021 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NCAPD2Q15021 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NCAPD2Q15021 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NCAPD2Q15021 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NCAPD2Q15021 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NCAPD2Q15021 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NCAPD2Q15021 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NCAPD2Q15021 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NCAPD2Q15021 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NCAPD2Q15021 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC30■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC30■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
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