Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
SHPRHQ149N8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
SHPRHQ149N8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC31.7■■■□□ 2.66
SHPRHQ149N8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
SHPRHQ149N8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
SHPRHQ149N8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
SHPRHQ149N8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SHPRHQ149N8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SHPRHQ149N8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SHPRHQ149N8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SHPRHQ149N8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SHPRHQ149N8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SHPRHQ149N8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SHPRHQ149N8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SHPRHQ149N8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SHPRHQ149N8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SHPRHQ149N8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SHPRHQ149N8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SHPRHQ149N8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SHPRHQ149N8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SHPRHQ149N8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SHPRHQ149N8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SHPRHQ149N8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SHPRHQ149N8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SHPRHQ149N8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SHPRHQ149N8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SHPRHQ149N8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SHPRHQ149N8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SHPRHQ149N8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SHPRHQ149N8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SHPRHQ149N8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SHPRHQ149N8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SHPRHQ149N8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SHPRHQ149N8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SHPRHQ149N8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SHPRHQ149N8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC31.57■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.65
SHPRHQ149N8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
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