Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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RAB39AQ14964 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB39AQ14964 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB39AQ14964 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB39AQ14964 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB39AQ14964 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB39AQ14964 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
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RAB39AQ14964 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB39AQ14964 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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RAB39AQ14964 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB39AQ14964 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB39AQ14964 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB39AQ14964 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB39AQ14964 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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RAB39AQ14964 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB39AQ14964 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB39AQ14964 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB39AQ14964 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB39AQ14964 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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RAB39AQ14964 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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RAB39AQ14964 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB39AQ14964 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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RAB39AQ14964 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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RAB39AQ14964 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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RAB39AQ14964 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB39AQ14964 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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