Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EBI3Q14213 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBI3Q14213 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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