Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE1CQ14123 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
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