Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PKP1Q13835 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PKP1Q13835 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKP1Q13835 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
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