Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALCAMQ13740 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
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