Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUL4BQ13620 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms