Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 ADD1-206ENST00000398129 3787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.884e-9■■■■□ 20.2
TRA2AQ13595 ADD1-217ENST00000513328 3107 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.894e-9■■■■□ 20.2
TRA2AQ13595 ADD1-218ENST00000513762 3581 ntTSL 38.93□□□□□ -0.984e-9■■■■□ 20.2
TRA2AQ13595 C21orf59-206ENST00000440966 1082 ntTSL 318.67■□□□□ 0.582e-7■■■■□ 20.1
TRA2AQ13595 C21orf59-207ENST00000458138 863 ntTSL 317.52■□□□□ 0.42e-7■■■■□ 20.1
TRA2AQ13595 C21orf59-202ENST00000300260 1243 ntTSL 217.47■□□□□ 0.392e-7■■■■□ 20.1
TRA2AQ13595 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.362e-7■■■■□ 20.1
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TRA2AQ13595 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.462e-7■■■■□ 20.1
TRA2AQ13595 AP000275.2-201ENST00000431216 891 ntAPPRIS P1 TSL 59.51□□□□□ -0.892e-7■■■■□ 20.1
TRA2AQ13595 NFKBIA-202ENST00000553342 212 ntTSL 520.13■□□□□ 0.813e-6■■■■□ 20
TRA2AQ13595 NFKBIA-205ENST00000555629 599 ntTSL 218.5■□□□□ 0.553e-6■■■■□ 20
TRA2AQ13595 NFKBIA-207ENST00000557100 825 ntTSL 317.38■□□□□ 0.373e-6■■■■□ 20
TRA2AQ13595 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.23e-6■■■■□ 20
TRA2AQ13595 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.133e-6■■■■□ 20
TRA2AQ13595 HDDC2-210ENST00000609574 607 ntTSL 215.87■□□□□ 0.133e-6■■■■□ 20
TRA2AQ13595 NFKBIA-210ENST00000557459 780 ntTSL 215.45■□□□□ 0.063e-6■■■■□ 20
TRA2AQ13595 NFKBIA-203ENST00000554001 1396 ntTSL 514.59□□□□□ -0.073e-6■■■■□ 20
TRA2AQ13595 CENPF-202ENST00000464322 689 ntTSL 214.29□□□□□ -0.127e-8■■■■□ 20
TRA2AQ13595 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.243e-6■■■■□ 20
TRA2AQ13595 CENPF-205ENST00000495259 345 ntTSL 312.91□□□□□ -0.347e-8■■■■□ 20
TRA2AQ13595 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.392e-8■■■■□ 20
TRA2AQ13595 ODF2-208ENST00000432065 934 ntTSL 512.06□□□□□ -0.483e-6■■■■□ 20
TRA2AQ13595 NFKBIA-208ENST00000557140 1400 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.493e-6■■■■□ 20
TRA2AQ13595 SPTY2D1-202ENST00000536336 2167 ntTSL 211.63□□□□□ -0.553e-6■■■■□ 20
TRA2AQ13595 G3BP2-201ENST00000357854 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.82e-8■■■■□ 20
TRA2AQ13595 G3BP2-203ENST00000395719 4217 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.252e-8■■■■□ 20
TRA2AQ13595 FKBP15-201ENST00000238256 4336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.273e-6■■■■□ 20
TRA2AQ13595 FKBP15-203ENST00000446284 8807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)6.4□□□□□ -1.383e-6■■■■□ 20
TRA2AQ13595 G3BP2-211ENST00000507947 665 ntTSL 26.03□□□□□ -1.442e-8■■■■□ 20
TRA2AQ13595 EIF3J-204ENST00000536248 533 ntTSL 24.1□□□□□ -1.751e-11■■■■□ 20
TRA2AQ13595 PCM1-219ENST00000523540 640 ntTSL 23.95□□□□□ -1.783e-6■■■■□ 20
TRA2AQ13595 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.983e-6■■■■□ 20
TRA2AQ13595 G3BP2-215ENST00000510902 338 ntTSL 32.38□□□□□ -2.032e-8■■■■□ 20
TRA2AQ13595 JMJD1C-203ENST00000402544 8011 ntTSL 1 (best)2.09□□□□□ -2.083e-6■■■■□ 20
TRA2AQ13595 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.183e-6■■■■□ 20
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TRA2AQ13595 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.698e-7■■■■□ 20
TRA2AQ13595 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.768e-7■■■■□ 20
TRA2AQ13595 U2SURP-203ENST00000463563 4364 ntTSL 22.78□□□□□ -1.968e-7■■■■□ 20
TRA2AQ13595 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.843e-9■■■■□ 20
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TRA2AQ13595 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.574e-8■■■■□ 20
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TRA2AQ13595 EIF4G1-229ENST00000457456 983 ntTSL 28.52□□□□□ -1.059e-17■■■■□ 19.9
TRA2AQ13595 RBM39-237ENST00000492779 2316 ntTSL 25.88□□□□□ -1.473e-11■■■■□ 19.9
TRA2AQ13595 SRSF11-208ENST00000463859 1035 ntTSL 53.07□□□□□ -1.922e-9■■■■□ 19.9
TRA2AQ13595 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.694e-6■■■■□ 19.8
TRA2AQ13595 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.774e-6■■■■□ 19.8
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TRA2AQ13595 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.324e-7■■■■□ 19.8
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TRA2AQ13595 CCDC136-201ENST00000297788 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.024e-7■■■■□ 19.8
TRA2AQ13595 NASP-215ENST00000528084 535 ntTSL 410.81□□□□□ -0.681e-11■■■■□ 19.8
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TRA2AQ13595 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.031e-8■■■■□ 19.8
TRA2AQ13595 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.111e-8■■■■□ 19.8
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TRA2AQ13595 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.192e-18■■■■□ 19.8
TRA2AQ13595 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.251e-8■■■■□ 19.8
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TRA2AQ13595 MGEA5-209ENST00000482611 1664 ntTSL 1 (best)5.35□□□□□ -1.551e-8■■■■□ 19.8
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TRA2AQ13595 NDUFB8-209ENST00000531418 585 ntTSL 317.36■□□□□ 0.375e-8■■■■□ 19.8
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TRA2AQ13595 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.075e-8■■■■□ 19.8
TRA2AQ13595 NDUFB8-206ENST00000528425 608 ntTSL 415.38■□□□□ 0.055e-8■■■■□ 19.8
TRA2AQ13595 NDUFB8-205ENST00000466088 829 ntTSL 215.17■□□□□ 0.025e-8■■■■□ 19.8
TRA2AQ13595 AL133352.1-202ENST00000527595 1423 ntAPPRIS ALT2 TSL 214.58□□□□□ -0.085e-8■■■■□ 19.8
TRA2AQ13595 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.175e-8■■■■□ 19.8
TRA2AQ13595 AL133352.1-201ENST00000529568 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 213.44□□□□□ -0.265e-8■■■■□ 19.8
TRA2AQ13595 NDUFB8-203ENST00000370322 713 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.485e-8■■■■□ 19.8
TRA2AQ13595 AL133352.1-205ENST00000533549 582 ntAPPRIS ALT2 TSL 411.76□□□□□ -0.535e-8■■■■□ 19.8
TRA2AQ13595 AL133352.1-204ENST00000528174 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 39.45□□□□□ -0.95e-8■■■■□ 19.8
TRA2AQ13595 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.286e-7■■■■□ 19.8
TRA2AQ13595 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.16e-7■■■■□ 19.8
TRA2AQ13595 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.116e-7■■■■□ 19.8
TRA2AQ13595 PSME1-208ENST00000561059 947 ntTSL 213.27□□□□□ -0.296e-7■■■■□ 19.8
TRA2AQ13595 PSME1-209ENST00000561142 865 ntTSL 513.27□□□□□ -0.296e-7■■■■□ 19.8
TRA2AQ13595 PSME1-210ENST00000561435 945 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.616e-7■■■■□ 19.8
TRA2AQ13595 PSME1-206ENST00000559741 763 ntTSL 39.84□□□□□ -0.836e-7■■■■□ 19.8
TRA2AQ13595 PSME1-203ENST00000470718 476 ntTSL 33.07□□□□□ -1.926e-7■■■■□ 19.8
TRA2AQ13595 NMT1-212ENST00000592654 558 ntTSL 47.4□□□□□ -1.222e-6■■■■□ 19.8
TRA2AQ13595 MAP1B-201ENST00000296755 12036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.982e-6■■■■□ 19.7
TRA2AQ13595 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.471e-6■■■■□ 19.7
TRA2AQ13595 MYO9B-207ENST00000595641 6215 ntTSL 511.7□□□□□ -0.541e-6■■■■□ 19.7
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