Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATMQ13315 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATMQ13315 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATMQ13315 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ATMQ13315 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATMQ13315 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATMQ13315 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATMQ13315 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATMQ13315 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATMQ13315 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATMQ13315 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ATMQ13315 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ATMQ13315 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATMQ13315 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATMQ13315 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATMQ13315 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATMQ13315 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATMQ13315 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATMQ13315 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATMQ13315 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATMQ13315 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATMQ13315 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATMQ13315 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATMQ13315 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATMQ13315 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATMQ13315 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ATMQ13315 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATMQ13315 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATMQ13315 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATMQ13315 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATMQ13315 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATMQ13315 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATMQ13315 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATMQ13315 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATMQ13315 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATMQ13315 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATMQ13315 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATMQ13315 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ATMQ13315 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATMQ13315 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATMQ13315 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATMQ13315 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATMQ13315 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATMQ13315 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATMQ13315 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ATMQ13315 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ATMQ13315 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATMQ13315 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATMQ13315 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATMQ13315 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATMQ13315 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATMQ13315 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATMQ13315 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATMQ13315 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATMQ13315 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATMQ13315 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATMQ13315 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATMQ13315 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATMQ13315 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATMQ13315 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATMQ13315 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATMQ13315 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATMQ13315 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ATMQ13315 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATMQ13315 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATMQ13315 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATMQ13315 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATMQ13315 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATMQ13315 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATMQ13315 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ATMQ13315 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATMQ13315 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ATMQ13315 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATMQ13315 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ATMQ13315 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATMQ13315 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ATMQ13315 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATMQ13315 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATMQ13315 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATMQ13315 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATMQ13315 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATMQ13315 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATMQ13315 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATMQ13315 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATMQ13315 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATMQ13315 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATMQ13315 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATMQ13315 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATMQ13315 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATMQ13315 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATMQ13315 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATMQ13315 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATMQ13315 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATMQ13315 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATMQ13315 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATMQ13315 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATMQ13315 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATMQ13315 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATMQ13315 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATMQ13315 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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