Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF6Q13247 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF6Q13247 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF6Q13247 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF6Q13247 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF6Q13247 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF6Q13247 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF6Q13247 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SRSF6Q13247 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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