Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ECH1Q13011 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ECH1Q13011 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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